Protein–RNA interactions for Protein: G3X9J0

Sipa1l3, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1l3G3X9J0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Sipa1l3G3X9J0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,51■■■■□ 3,27
Sipa1l3G3X9J0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,45■■■■□ 3,27
Sipa1l3G3X9J0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Sipa1l3G3X9J0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,4■■■■□ 3,26
Sipa1l3G3X9J0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Sipa1l3G3X9J0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Sipa1l3G3X9J0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Sipa1l3G3X9J0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Sipa1l3G3X9J0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Sipa1l3G3X9J0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Sipa1l3G3X9J0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Sipa1l3G3X9J0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Sipa1l3G3X9J0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Sipa1l3G3X9J0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Sipa1l3G3X9J0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Sipa1l3G3X9J0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Sipa1l3G3X9J0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Sipa1l3G3X9J0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Sipa1l3G3X9J0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Sipa1l3G3X9J0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Sipa1l3G3X9J0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Sipa1l3G3X9J0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Sipa1l3G3X9J0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Sipa1l3G3X9J0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Sipa1l3G3X9J0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Sipa1l3G3X9J0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Sipa1l3G3X9J0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,71■■■■□ 3,15
Sipa1l3G3X9J0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Sipa1l3G3X9J0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Sipa1l3G3X9J0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Sipa1l3G3X9J0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Sipa1l3G3X9J0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Sipa1l3G3X9J0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Sipa1l3G3X9J0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Sipa1l3G3X9J0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Sipa1l3G3X9J0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Sipa1l3G3X9J0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Sipa1l3G3X9J0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,54■■■■□ 3,12
Sipa1l3G3X9J0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Sipa1l3G3X9J0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Sipa1l3G3X9J0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Sipa1l3G3X9J0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Sipa1l3G3X9J0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,44■■■■□ 3,1
Sipa1l3G3X9J0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Sipa1l3G3X9J0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,37■■■■□ 3,09
Sipa1l3G3X9J0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Sipa1l3G3X9J0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Sipa1l3G3X9J0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Sipa1l3G3X9J0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Sipa1l3G3X9J0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Sipa1l3G3X9J0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Sipa1l3G3X9J0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Sipa1l3G3X9J0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Sipa1l3G3X9J0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Sipa1l3G3X9J0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Sipa1l3G3X9J0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Sipa1l3G3X9J0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Sipa1l3G3X9J0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Sipa1l3G3X9J0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Sipa1l3G3X9J0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Sipa1l3G3X9J0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Sipa1l3G3X9J0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Sipa1l3G3X9J0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Sipa1l3G3X9J0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Sipa1l3G3X9J0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Sipa1l3G3X9J0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Sipa1l3G3X9J0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
Sipa1l3G3X9J0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Sipa1l3G3X9J0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Sipa1l3G3X9J0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Sipa1l3G3X9J0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Sipa1l3G3X9J0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Sipa1l3G3X9J0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Sipa1l3G3X9J0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Sipa1l3G3X9J0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Sipa1l3G3X9J0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Sipa1l3G3X9J0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Sipa1l3G3X9J0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Sipa1l3G3X9J0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Sipa1l3G3X9J0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Sipa1l3G3X9J0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Sipa1l3G3X9J0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33,61■■■□□ 2,97
Sipa1l3G3X9J0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Sipa1l3G3X9J0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Sipa1l3G3X9J0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Sipa1l3G3X9J0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Sipa1l3G3X9J0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,97
Sipa1l3G3X9J0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Sipa1l3G3X9J0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Sipa1l3G3X9J0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Sipa1l3G3X9J0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Sipa1l3G3X9J0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Sipa1l3G3X9J0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Sipa1l3G3X9J0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Sipa1l3G3X9J0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,44■■■□□ 2,94
Sipa1l3G3X9J0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Sipa1l3G3X9J0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Sipa1l3G3X9J0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Sipa1l3G3X9J0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,8 ms