Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms