Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms