Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DKK2Q9UBU2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms