Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms