Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms