Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COMMD8Q9NX08 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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