Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms