Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms