Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms