Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms