Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG4Q92954 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms