Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms