Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOPBP1Q92547 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms