Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms