Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ZNF248Q8NDW4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ZNF248Q8NDW4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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ZNF248Q8NDW4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ZNF248Q8NDW4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ZNF248Q8NDW4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ZNF248Q8NDW4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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