Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms