Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms