Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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