Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms