Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMBOX1Q6NT76 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMBOX1Q6NT76 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMBOX1Q6NT76 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMBOX1Q6NT76 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMBOX1Q6NT76 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMBOX1Q6NT76 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMBOX1Q6NT76 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms