Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHBQ15464 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHBQ15464 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms