Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RASGRF1Q13972 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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