Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms