Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms