Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP140Q13342 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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