Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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CNTN1Q12860 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CNTN1Q12860 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CNTN1Q12860 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CNTN1Q12860 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CNTN1Q12860 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CNTN1Q12860 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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