Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms