Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC025419.1-202ENST00000535315 744 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms