Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms