Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GEMP55040 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEMP55040 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GEMP55040 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GEMP55040 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEMP55040 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms