Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUFMP49411 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUFMP49411 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUFMP49411 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUFMP49411 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUFMP49411 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUFMP49411 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUFMP49411 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUFMP49411 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUFMP49411 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUFMP49411 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUFMP49411 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUFMP49411 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUFMP49411 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUFMP49411 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUFMP49411 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUFMP49411 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms