Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms