Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms