Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms