Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT1P21579 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT1P21579 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT1P21579 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT1P21579 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT1P21579 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT1P21579 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT1P21579 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT1P21579 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT1P21579 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms