Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBPP18428 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LBPP18428 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms