Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC4P09017 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms