Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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