Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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