Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms