Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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