Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CACNA1GO43497 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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