Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNMO15061 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNMO15061 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNMO15061 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNMO15061 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms