Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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