Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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