Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNRGQ9UMZ2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms