Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms