Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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