Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms